确定审计重点后，就要对具体的合同项目进行解剖。审计实践表明，在建设项目管理的全过程，招投标、合同签订与工程价款结算三个环节最容易暗箱操作，发生徇私舞弊、利益输送的可能性大，而三者本身也具有一定的关联性，可以关联分析。例如，若发现招投标程序存在重大问题，则应联系价款结算情况，审查有无高估冒算造成国有资产损失的问题;若发现价款结算有较大水分，也要考虑倒查招投标程序与合同条款的问题。总之，审计中利用整体思维，更容易发现利益输送和贪污腐败等深层次问题。

　　(一)招投标审查

　　一是审查招投标程序。善于抓住影响招投标的关键条款和信息。如招标公告在哪儿发布、发布日期与投标截止日等是关键信息，审计中不乏遇到仅在单位官网发布公告及缩短发布日期的情况。对于非关键信息，不必面面俱到逐条核对，影响工作效率。

　　二是关注有无特定条件排斥潜在投标人的问题。较常见的有：要求投标人具备特定区域业绩、奖项、资质、品牌;设定与招标项目不相适应的技术参数或产品规格等，常见于机电、弱电、专业设备等小众招标项目;要求投标人必须在某个政府供应商列表内;提高投标保证金门槛。

　　三是发现围标串标线索。可以从以下方面入手：对比投标文件，审查有无商务标报价规律性变化或技术标雷同;通过查询各投标人账户银行流水，追踪保证金的转入转出，查证在投标前是否存在由一家单位向其他投标人转入投标保证金，并在开标后不久原路径转回的情况;审查招标人和中标人在开标前是否签订意向性协议。

　　(二)合同签订及履约审查

　　一是价款结算条款，将合同特别是后期签订的补充合同与格式合同、市场惯例和通行做法进行对比，审查有无违背相关规定、有悖公平公正或不合常理的结算条款，特别是不利于建设单位的条款。一般来说，这类条款可能是建设单位的决策层或合同拟定部门出于某种考虑，同意了承包单位请求甚至主动设置的，要查明背景直至责任人。

　　二是奖惩条款，审查是否按合同约定对未配备相关人员、未达到工期和质量目标等违约行为进行处罚。不能轻信建设单位的解释说明，应结合相关工程资料进行分析判断。

　　三是风险条款，审查施工单位是否按合同约定承担了相应的风险，一般表现为价格风险，重点审查是否存在通过补充约定，将施工单位价格风险转嫁建设单位的情况。

　　(三)价款结算审查

　　价款结算审查是有针对性地对已经结算的项目进行复核，审查的目的是揭示高估冒算和潜在的利益输送问题。

　　一方面，对合同内价款的审查，一般可以根据经验或结合当地造价指标比较合同价与同期市场价，对明显高于市场价的要追溯招投标环节，审查有无串通投标哄抬价格等。例如，在竞争激烈的工程领域，投标人却仅有三家，往往存在暗箱操作、围标串标的可能。

　　另一方面，对合同外变更价款特别是大的变更、签证，要对照合同条款仔细审查，分析程序的合规性、变更的合理性和计量计价的准确性。必要时可以借助外部专家的力量进行合理性和准确性审查，研判其中可能存在的“猫腻”。例如，在景观绿化工程结算中，审查苗木种类的变更、实际栽种的大小是否与合同约定相符等。